世田谷区と港区では雲泥の差があります。

http://q.hatena.ne.jp/1194935316
http://www.city.setagaya.tokyo.jp/030/d00016104.html
世田谷区では、記載要領も用意されていて「住宅借入金等特別税額控除申告書」をダウンロードできます。「添付ファイルのダウンロード」の1と3を参照しますと、宛先が「世田谷区長あて」になっていますので、他の区では利用できないです。
http://www.city.minato.tokyo.jp/kurasi/zeikin/topics/jutaku/index.html
一方、港区は次のような説明文が掲載されているだけでダウンロードすることは現時点では不可となっています。

【手続き】
 平成19年分の所得税から控除しきれない額が発生した場合、平成20年3月17日までに「住宅借入金等特別税額控除申告書」を提出してください。申告書は平成20年2月頃に区役所税務課・各総合支所・税務署の窓口に備え置く予定です。